# 11RNA介导的局部染色质修饰对可变剪切的调控

## Regulation of alternative splicing by local histone modifications: potential roles for RNA-guided mechanisms

原文链接 <https://doi.org/10.1093/nar/gkt875>

### Abstract

对应组蛋白修饰和可变剪切的分子机制已经有了一定的了解。作者将之前两个分开研究的领域结合起来，发现**核小体更加偏向性的定位在外显子区域、DNA甲基化与组蛋白修饰同样是富集在外显子区域**这些发现表明染色质结构、组蛋白修饰和剪切调控存在一定的联系。同时报道了形成可变剪切的新的机制---**RNA介导的**其中就包括：

* snRNA,通过改变靶向区域的组蛋白甲基化程度，形成局部的异染色质化来影响可变剪切，
* pre-RNA自身招募组蛋白修饰酶
* lnRNA

### Introduction

* 在人类中95%的多外显子基因，存在可变剪切

移除pre-mRNA是通过剪切复合体（5个snRNA和300多个蛋白质组成）去执行的，

通常剪切过程是开始于序列识别的，顺式作用元件通过招募反式作用因子形成**外显子定义复合物**。在真核生物中147bp的DNA序列被核小体包裹影响DNA的可及性，其中就包括转录 、DNA重组等过程。与此同时，组蛋白的修饰在基因组水平上划分了功能区域与非功能区域，这会影响反式作用因子的招募。

* 核小体在外显子的密度比内含子高，表明核小体在染色质水平上定义了外显子，这在分子水平上可以解释，因子核小体在转录过程中可以相当于一个屏障的作用，抑制RNA聚合酶Ⅱ的移动，使得剪切复合体有时间将外显子识别并剪切下来。
* DNA甲基化与  intron–exon junctions   有关联，并且通常富集在外显子区域，可以作为定义外显子的标记

组蛋白标记通过两种机制调节可变剪切，表观遗传调控可变剪切，RNA介导的组蛋白修饰调节可变剪切。

### Result

表观上调控可变剪切的两种途径

* 动力学耦合

  转录的延伸速率和可变剪切的识别速率
* Chromatin-splicing adaptor systems

各种组蛋白标记通过招募一些蛋白，影响RNA聚合酶Ⅱ的移动速率，影响可变剪切复合体的识别

![组蛋白修饰与可变剪切](https://user-images.githubusercontent.com/39325949/67469508-dfa5ad80-f67e-11e9-8099-944930bc48e4.png)

甲基化会影响外显子的识别

* DNA-binding蛋白**CTCF**会使得RNA聚合酶Ⅱpause，使得外显子被识别，而高水平的5-mC会阻断CTCF结合到DNA从而使得不能够识别外显子。

RNA介导的染色质修饰

![RNA介导的可变剪切机制](https://user-images.githubusercontent.com/39325949/67469699-24c9df80-f67f-11e9-98a3-f026c60becda.png)