02诺和致源下载数据

1.下载脚本

wget http://api.data-deliver.novogene.com/welcome/shell?f=linux
#解压安装包
unzip shell?f=linux
#给可执行权限
cd linuxnd
chmod 755  linuxnd

2. 登录账户

./linuxnd login -u 用户名 -p

3.下载数据

./software/novogene/linuxnd/linuxnd cp -d   oss://CP2018091202596/H101SC19090378/KY_kehu_JK/X101SC19090378-Z01/X101SC19090378-Z01-F001/ HPC22
  • -d 下载整个目录到本地

  • oss为云对象存储

  • 第三个为本地目录

使用新版客户端

wget http://gosspublic.alicdn.com/ossutil/1.6.7/ossutil64
  • 配置bucket

     ./ossutil64 config --config-file /public/home/zpliu/software/novogene/ossutilconfig
     ### 交互式输入后的配置文件内容
     [Credentials]
    language=EN
    accessKeyID=
    accessKeySecret=
    endpoint=oss://pangoo-bj/customer-OjjTVnb2/
    
     ### 另外一种配置命令
      ./ossutil config -e oss.aliyuncs.com -i your_id -k AccessKeySecret

    所有域名数数据中心 https://helpcdn.aliyun.com/document_detail/31837.html?spm=a2c4g.11186623.2.17.4e49448aEeERSg#concept-zt4-cvy-5db

  • 下载文件

        ossutil cp oss_path local_path -r –f --jobs 3 --parallel 2
      -r: 下载oss路径下的文件及文件夹;不加此参数,只会下载目录下的文件
      -f: 如果local_path存在,会强制覆盖;不加此参数,ossutil会询问是否覆盖
      --jobs  --parallel(并发控制选项):在机器资源有限的情况下,可能会因为网络传输太慢,产生E0F错误

Last updated