ANALYSIS

DE genes

• 第一列和第二列表示参考基因组gtf文件中的基因编号与name

• 每一列表示这一个簇的细胞与所有其他剩余的细胞的差异

  • 当点击这Cluster1时，其他簇上的数字，则是对应于，这一列上L2FC的值与p-value

  • 只有在上调的基因才会被显示，下调的基因或者p-value>0.1 统计学上不显著则会被显示为灰色

  • cluster1 与其他所有的细胞相比，基因是上调的L2FC为 4.91

  • cluster1 与Cluster 2相比则是下调的，L2FC为 -2.8

2-D space

将所有的细胞降维到二维空间，颜色的深浅表示UMI数目的多少

聚类Cluster

根据之前降维的结果，和细胞的表达模式，将不同的细胞进行聚类

右上角可以选择具体的聚类数目，这会改变differ Express 表格的内容