BARcoded BAM

cell ranger 输出的索引BAM文件中包含了序列的比对信息，并且这个文件是按照基因组染色体的顺序排好序的，不是按照reads编号的顺序

温习一下BAM文件的格式

官方文档 http://211.69.141.6/cache/4/03/samtools.github.io/0dbb623f50f0aa48946e3633f9663af6/SAMv1.pdf