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cell ranger 输出的索引BAM文件中包含了序列的比对信息,并且这个文件是按照基因组染色体的顺序排好序的,不是按照reads编号的顺序
官方文档 http://211.69.141.6/cache/4/03/samtools.github.io/0dbb623f50f0aa48946e3633f9663af6/SAMv1.pdf