EMBOSS
根据全长转录本cDNA序列预测ORF
find 3号模式下输出从起始到终止的碱基信息
因为用cDNA序列去预测，所以不用反转
判断ORF是否存在提前终止的密码子
先看看注释的参考基因组中转录本的情况，是不是符合人类中的研究；再看各种AS产生的isform的情况
提取所有isform的cDNA序列预测其ORF
根据EMBOSS预测的ORF序列，提取最长的ORF序列，判断终止密码子与最后一个exon的距离；
其中发生AS的isform含有距离大于50nt
而没有发生AS的isform含有距离小于50nt
我感觉只有其中距离是可以调节的，只要发生AS的isoform比没有发生AS的isoform提取终止就行
针对每种类型的AS进行计算
使用NCBI的ORFfinder搜索cDNA中的ORF
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