MEME本地化

使用

meme ../TM1sequence.fa  -rna -oc .  -mod zoops   -nmotifs 50 -minw 6 -maxw 20

• input.fasta 可以是 DNA、RNA 或 蛋白质序列。

• -protein 指定 input.fasta 的类型。

• -oc 指定输出文件路径，. 即为当前目录。

• -mod 假定 motif 的分布模式，详见 http://meme-suite.org/doc/meme.html。

• -minw motif 的最小宽度。

• -maxw motif 的最大宽度。

参考

1. https://hui-liu.github.io/blog/meme%E6%9C%AC%E5%9C%B0%E7%89%88%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8/