03植物中的表观遗传

The Epigenome and Plant Development

原文链接：https://www.annualreviews.org/doi/full/10.1146/annurev-arplant-042110-103806

Abstract

• 表观遗传通过调节染色体结构和基因组的稳定，整合遗传信息最终决定表型

• 通过高通量测序技术和染色质技术，整合多种类型表观遗传，分析这些信息在植物的不同环境条件、不同发育阶段中起到的作用

• small RNA

• DNA甲基化

• 组蛋白修饰

• 在植物的进化过程中，表观遗传的编译同样对表型的分化起着重要的作用，有可能是导致一些复杂生物性状产生的机制，就比如杂种优势

背景知识

• DNA甲基化

  DNA甲基转移酶在胞嘧啶的5‘位置上添加一个甲基，同时包含3种类型的甲基化和对应催化的酶

  • MET1 催化 CG甲基化

  • CMT3 催化 CHH甲基化

  • DRM2 催化 不对称的CHH甲基化

  主要的功能 ： 通过抑制转座子和其他的重复序列，来维持基因组序列的的稳定，同时在一定程度上可以调节基因的表达

  甲基化也可以被移除，通过一些生物途径，胞嘧啶上的甲基被酶催化移除甲基

  • DME

  • ROS1

  • DML2

  • DML3

• 组蛋白修饰

  组蛋白修饰是一种对蛋白质翻译后的修饰PTMs，对调节基因表达起着重要的作用；调控基因组的可及性

  主要的类型

  • 乙酰化 被 HATs催化可以被HDACs去乙酰化

  • 甲基化 被HKMTs甲基化，被HDMs去甲基化

• siRNA

  是一种24个核苷酸，作用起源于长的双链RNA，产生于转座子或者重复序列

  对基因组的完整性和基因的活性起着重要的作用

结果