gffutils
gffutils是基于
splite3
database对注释信息进行存储,因此能实现非常快速的查询,相比于一些文本工具
1.创建GFF数据库
这个操作只需要进行一次就行,之后就可以直接使用这个数据库,包含的一些参数如下:
force=True
覆盖已有的数据库keep_order=True
属性的顺序( ID, Name, Parent, and so on )sort_attribute_values=True
给属性的值排序
2.查询数据库中的内容
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